葛瑛团队使用自上而下质谱法提醒新冠病毒刺突蛋白受体结合域的结构 O-糖型异质性

  葛瑛团队使用自上而下质谱法提醒新冠病毒刺突蛋白受体结合域的结构 O-糖型异质性

  该内容初次在结构上阐明晰一共八种O-糖型及其相对分子丰度。该发现标明，这种自上而下的混合质谱剖析办法可以供给S糖蛋白的不同 O-糖型的高分辩率蛋白质型解析图，这为提醒其 O-聚糖的功用效果奠定了根底。

  据WHO官网数据显现，到2021年8月6日，新式冠状病毒(SARS-CoV-2)已致全球2亿人感染，425万人逝世，这是本世纪最为严峻的全球公共性卫生事件。

  刺突蛋白(Spike, S)是病毒外表重要的标志蛋白，是一种三个相同亚基以非共价键结组成同源三聚体;一起刺突蛋白存在多个N-糖基化位点，糖基经过共价键与蛋白相连组成糖蛋白，而很多糖基的存在则可经过糖基化改动蛋白质分子的空间结构而关闭或损坏抗原表位，然后按捺机体发生免疫应对，对病毒起到维护效果。刺突蛋白的序列首要包含N端结构域(N-Terminal Domain,NTD)、受体结合结构域(Receptor Binding Domain,RBD)、交融肽段(Fusion peptide，FP)、2段七肽重复序列(Heptad Repeat，HR)、中心螺旋(Central Helix，CH)、衔接域(Connector Domian,CD)、跨膜结构域(Transmembrane Domain,TD)等。

  SARS-CoV-2经过高度糖基化的刺突蛋白(Spike, S)上的受体结合域(RBD)与人受体蛋白血管严重素转化酶(ACE2)结合，从而侵略人体细胞，因而刺突蛋白糖基化在改动病毒结合/功用和感染性方面起着关键效果。但是因为传统自下而上糖蛋白组学办法剖析完好糖型面对应战，因而在刺突蛋白受体结合域(S-RBD) 上提醒新O-聚糖的分子结构和聚糖异质性仍是个难题。

  该作业中，研讨人员经过使用捕集离子淌度 (TIMS)-四极杆飞翔时刻质谱法和超高分辩率傅里叶变换离子回旋共振质谱法解析了完好的 O-聚糖蛋白型的完好结构。自上而下的 TIMS-MS/MS 别离 S-RBD 的蛋白质构象异构体以提醒其气相结构异质性，而自上而下的 FTICR-MS/MS 供给深化的糖型剖析，以清晰辨认聚糖结构和他们的糖基。

  该作业内容初次在结构上阐明晰一共八种O-糖型及其相对分子丰度。该发现标明，这种自上而下的混合质谱剖析办法可以给我们供给S糖蛋白的不同 O-糖型的高分辩率蛋白质型解析图，这为提醒其 O-聚糖的功用效果奠定了强壮的分子根底。这种蛋白质型解析办法可用于提醒新出现的 SARS-CoV-2 S-RBD 变体以及其他 O-糖蛋白的结构 O-糖型异质性。

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